配对是繁殖动物和获取新物种的核心机制。要成功配对，玩家需要拥有一对同种类的成年雄性和雌性动物，并将它们放入同一动物房中。配对过程会消耗食物和时间，具体消耗量取决于动物种类和等级。通过使用特殊道具可以提升配对成功率或缩短等待时间，这些道具可通过完成任务或参与活动获得。配对成功后会产生动物蛋，需要在动物房中孵化才能得到新动物。
配对系统的一个重要细节是基因属性的遗传机制。每只动物都拥有力量、敏捷、智力等基因属性，这些属性会影响新生动物的基础数值。因此建议在配对前优先选择基因属性较高的动物作为亲本，以提高后代的质量。即使使用相同的亲本配对，新生动物仍存在一定随机性，可能产生属性差异或外观变异的个体。这种设计增加了游戏的收集乐趣和重复可玩性。
对于想要快速刷配对的玩家，存在一种特殊技巧：使用复活鸟道具后，开局立即自杀并重复此过程，有一定几率触发特定动物的配对机会。这种方法虽然效率较高，但需要消耗复活道具作为前提条件。栖息地等级也会影响配对效果，升级栖息地不仅能提高动物舒适度，还能增加稀有动物在配对中的出现概率。
配对获得的动物蛋需要经过孵化阶段才能投入使用。孵化期间建议合理安排动物房空间，避免因空位不足影响其他操作。通过提供充足食物可以缩短孵化时间，但要注意资源分配的平衡性。完成配对的动物会进入图鉴系统，玩家可以随时查看已收集的品种和属性信息，这对规划后续的配对策略具有重要参考价值。
