战机编队是无尽的拉格朗日太空战斗的核心策略之一，合理配置战机类型和数量直接影响战斗效率。战机的定位主要分为轰炸机、强击机、攻击机等类型，每种类型在战斗中承担不同职责。轰炸机如维塔斯B010和牛蛙型，擅长对舰和攻城，但缺乏对空能力；强击机如林鸮A100和佩刀Aer410，兼具对空对舰能力；攻击机如孢子A404则专职防空。编队时需根据敌方阵容选择战机组合，例如面对舰载机较多的敌人应优先配置防空型战机。
战机的站位和战斗序列是编队的重要考量因素。舰载机随母舰行动，其攻击优先级通常由武器系统的战斗序列决定。轰炸机因攻击冷却时间长，需搭配高生存能力的母舰或护航艇保护；强击机和攻击机则更依赖快速锁定和持续输出能力。编队时需注意战机与母舰的协同，例如谷神星载机作为指挥舰时，可优先搭载高攻战机提升整体火力。战机数量不宜过多，否则会挤占舰队指挥值，影响其他舰船配置。
战机的技能加点是编队优化的关键环节。维塔斯B010建议优先加点单发伤害和锁定时间，以发挥其高爆发特性；牛蛙型则需强化冷却时间和攻城能力，弥补生存力不足的缺陷；林鸮A100应重点提升对舰伤害和策略技能，增强对护航艇的针对性。防空型战机如孢子A404需最大化对空属性，而干扰型战机如安德森SC020则应强化生存能力。加点方向需与编队战术目标一致，例如专注拆家的队伍可牺牲部分防御属性换取更高攻城效率。
实战中战机编队需配合侦查与火力压制战术。具有侦查能力的战机可提前获取敌方信息，为轰炸机创造输出环境；火力压制型战机则能快速突破敌方防线。编队时需注意战机与舰队其他单位的配合，例如搭配防空舰船保护高价值轰炸机，或利用高速护卫舰吸引火力。封锁任务中可部署专用编队持续刷野，但需注意后勤补给和维修效率。战机编队的移动速度取决于舰队最慢单位，因此高速战机不宜与龟速舰船混编。
后期编队需考虑战机升级与改装路径。通过战略打击获得的经验值可提升战机等级，增强基础属性；改装则能改变战机技能或增加新模块。优先升级核心战机如小米、T800、星脉等，使其快速形成战斗力。改装方向需符合编队定位，例如专注对舰的编队可强化穿甲属性，而防空编队则应提升命中率。维修舰船在后期编队中作用有限，通常建议替换为输出型单位，但对抗NPC时仍可保留少量维修支援。
